| 1. Round | 24/09/2003 | Brøndby IF | - | Viktoria Žižkov | 1:0 | ||||
| 1. Round | 16/10/2003 | Viktoria Žižkov | - | Brøndby IF | 0:1 | ||||
| 2. Round | 06/11/2003 | FC Schalke 04 | - | Brøndby IF | 2:1 |  |
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| 2. Round | 27/11/2003 | Brøndby IF | - | FC Schalke 04 | 3:1 pso | |
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| 3. Round | 26/02/2004 | Brøndby IF | - | FC Barcelona | 0:1 | ||||
| 3. Round | 03/03/2004 | FC Barcelona | - | Brøndby IF | 2:1 |
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