| 19. Round | 29/02/2000 | NK Istra Pula | - | HNK Rijeka | 1:0 | ||||
| 20. Round | 04/03/2000 | HNK Cibalia | - | NK Istra Pula | 3:1 | ||||
| 21. Round | 07/03/2000 | NK Vukovar 91 | - | NK Istra Pula | 1:3 | ||||
| 22. Round | 11/03/2000 | NK Istra Pula | - | NK Zagreb | 0:0 |  |
|||
| 23. Round | 18/03/2000 | NK Zagreb | - | NK Istra Pula | 4:1 | ||||
| 24. Round | 25/03/2000 | NK Istra Pula | - | HNK Rijeka | 2:1 |  |
|||
| 26. Round | 08/04/2000 | NK Istra Pula | - | Hajduk Split | 1:1 | ||||
| 27. Round | 11/04/2000 | Croatia Zagreb | - | NK Istra Pula | 2:0 | ||||
| 28. Round | 15/04/2000 | NK Istra Pula | - | Slaven Belupo | 0:1 | |
|||
| 29. Round | 24/04/2000 | Hrvatski Dragovoljac | - | NK Istra Pula | 2:0 |
Croatia