| 1. Round | 22/09/2024 | PAOK Saloniki II | - | AEP Iraklis FC | 0:0 |  |
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| 4. Round | 12/10/2024 | AE Lárissa | - | AEP Iraklis FC | 3:0 | ||||
| 5. Round | 20/10/2024 | AEP Iraklis FC | - | Ethnikos Neou Keramidiou | 1:0 |  |
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| 6. Round | 25/10/2024 | AEP Iraklis FC | - | Diagoras FC | 1:0 | ||||
| 7. Round | 02/11/2024 | Niki Volou FC | - | AEP Iraklis FC | 1:0 | |
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| 8. Round | 08/11/2024 | AEP Iraklis FC | - | Makedonikos FC | 3:0 | ||||
| 13. Round | 14/12/2024 | AEP Iraklis FC | - | AE Lárissa | 1:2 | ||||
| 14. Round | 20/12/2024 | Ethnikos Neou Keramidiou | - | AEP Iraklis FC | 0:1 |
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