| 3. Round | 12/09/1998 | Veria FC | - | Olympiakos Piraeus | 0:3 | ||||
| 18. Round | 06/02/1999 | Iraklis Saloniki | - | Veria FC | 2:0 | ||||
| 24. Round | 20/03/1999 | Veria FC | - | Panionios GSS | 3:1 | ||||
| 25. Round | 03/04/1999 | OFI Heraklion | - | Veria FC | 3:0 | ||||
| 26. Round | 17/04/1999 | Veria FC | - | Paniliakos Pyrgos | 0:0 | ||||
| 27. Round | 24/04/1999 | AO Proodeftiki | - | Veria FC | 1:0 | ||||
| 28. Round | 02/05/1999 | Veria FC | - | Ethnikos Asteras | 3:1 | ||||
| 29. Round | 08/05/1999 | PAOK Saloniki | - | Veria FC | 2:0 | ||||
| 30. Round | 11/05/1999 | Veria FC | - | Ionikos Nikea | 0:2 | ||||
| 31. Round | 15/05/1999 | Aris Saloniki | - | Veria FC | 2:0 | ||||
| 32. Round | 19/05/1999 | Veria FC | - | AO Kavala | 0:2 | ||||
| 33. Round | 22/05/1999 | Panathinaikos | - | Veria FC | 1:0 |
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