| 19. Round | 29/01/2012 | PAS Giannina | - | Panetolikos | 1:0 | ||||
| 20. Round | 05/02/2012 | Panetolikos | - | Atromitos | 1:1 | ||||
| 6. Round | 08/02/2012 | Panetolikos | - | Doxa Dramas FC | 0:2 | ||||
| 21. Round | 12/02/2012 | Doxa Dramas FC | - | Panetolikos | 2:1 | ||||
| 23. Round | 03/03/2012 | Skoda Xanthi | - | Panetolikos | 0:1 | ||||
| 24. Round | 11/03/2012 | Panetolikos | - | Ergotelis | 2:0 | ||||
| 25. Round | 18/03/2012 | Panetolikos | - | PAOK Saloniki | 1:1 | ||||
| 26. Round | 25/03/2012 | AEK Athen | - | Panetolikos | 1:0 | ||||
| 28. Round | 08/04/2012 | OFI Heraklion | - | Panetolikos | 1:0 |
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