| 3. Round | 31/07/2016 | Chiapas FC | - | Deportivo Toluca | 1:0 | ||||
| 4. Round | 07/08/2016 | UANL Tigres | - | Chiapas FC | 1:0 | ||||
| 5. Round | 14/08/2016 | Chiapas FC | - | CD Veracruz | 1:1 | ||||
| 6. Round | 21/08/2016 | Monarcas Morelia | - | Chiapas FC | 3:2 | ||||
| 7. Round | 28/08/2016 | Chiapas FC | - | Puebla FC | 0:3 | ||||
| 8. Round | 11/09/2016 | Deportivo Guadalajara | - | Chiapas FC | 2:0 | ||||
| 9. Round | 18/09/2016 | Chiapas FC | - | Cruz Azul | 0:3 |  |
|||
| 10. Round | 22/09/2016 | Club León | - | Chiapas FC | 0:0 | ||||
| 11. Round | 24/09/2016 | Chiapas FC | - | Club Necaxa | 2:2 | ||||
| 12. Round | 02/10/2016 | Pumas UNAM | - | Chiapas FC | 1:0 | ||||
| 16. Round | 07/11/2016 | Santos Laguna | - | Chiapas FC | 2:0 | ||||
| 17. Round | 19/11/2016 | Chiapas FC | - | Atlas Guadalajara | 1:0 |
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