| 5. Round | 11/08/2013 | Atlas Guadalajara | - | CF Pachuca | 1:1 | ||||
| 6. Round | 17/08/2013 | Monarcas Morelia | - | Atlas Guadalajara | 2:0 | ||||
| 7. Round | 25/08/2013 | Atlas Guadalajara | - | Pumas UNAM | 1:1 | ||||
| 8. Round | 01/09/2013 | CF Monterrey | - | Atlas Guadalajara | 0:0 | ||||
| 9. Round | 08/09/2013 | Atlas Guadalajara | - | Santos Laguna | 2:2 | ||||
| 10. Round | 15/09/2013 | Chiapas FC | - | Atlas Guadalajara | 3:0 | ||||
| 11. Round | 22/09/2013 | Atlas Guadalajara | - | CD Veracruz | 3:3 | ||||
| 12. Round | 29/09/2013 | Deportivo Guadalajara | - | Atlas Guadalajara | 1:1 |  |
|||
| 13. Round | 06/10/2013 | Atlas Guadalajara | - | Cruz Azul | 1:2 | ||||
| 14. Round | 20/10/2013 | Puebla FC | - | Atlas Guadalajara | 2:0 | ||||
| 16. Round | 03/11/2013 | Deportivo Toluca | - | Atlas Guadalajara | 1:1 | ||||
| 17. Round | 10/11/2013 | Atlas Guadalajara | - | UANL Tigres | 0:1 |
Mexico