| 1. Round | 28/08/2005 | Panionios GSS | - | AE Lárissa | 1:1 | ||||
| 6. Round | 16/10/2005 | Panionios GSS | - | GS Kallithea | 1:0 |  |
|||
| 7. Round | 23/10/2005 | Akratitos Liosion | - | Panionios GSS | 0:1 | ||||
| 8. Round | 31/10/2005 | Panionios GSS | - | AEK Athen | 0:2 | ||||
| 11. Round | 27/11/2005 | Apollon Kalamarias | - | Panionios GSS | 1:0 | ||||
| 12. Round | 05/12/2005 | Panionios GSS | - | Skoda Xanthi | 0:2 | |
|||
| 13. Round | 11/12/2005 | Panionios GSS | - | Atromitos | 2:0 | ||||
| 14. Round | 18/12/2005 | Iraklis Saloniki | - | Panionios GSS | 1:0 | |
|||
| 15. Round | 07/01/2006 | Panionios GSS | - | AO Egaleo | 0:1 | ||||
| 16. Round | 16/01/2006 | AE Lárissa | - | Panionios GSS | 1:0 | ||||
| 17. Round | 30/01/2006 | Panionios GSS | - | Olympiakos Piraeus | 2:3 | |
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