| 1. Round | 22/08/2009 | Skoda Xanthi | - | PAS Giannina | 1:1 |  |
|||
| 2. Round | 30/08/2009 | PAS Giannina | - | Panthrakikos | 2:0 | ||||
| 3. Round | 12/09/2009 | Aris Saloniki | - | PAS Giannina | 1:0 | ||||
| 5. Round | 26/09/2009 | AE Lárissa | - | PAS Giannina | 0:0 | ||||
| 6. Round | 03/10/2009 | PAS Giannina | - | AO Kavala | 2:1 | ||||
| 11. Round | 21/11/2009 | PAS Giannina | - | Olympiakos Piraeus | 2:2 | ||||
| 12. Round | 29/11/2009 | Atromitos | - | PAS Giannina | 2:1 | ||||
| 14. Round | 12/12/2009 | PAS Giannina | - | Ergotelis | 1:0 | |
|||
| 15. Round | 19/12/2009 | Panathinaikos | - | PAS Giannina | 4:0 | ||||
| 16. Round | 06/01/2010 | PAS Giannina | - | Skoda Xanthi | 0:0 | ||||
| 17. Round | 10/01/2010 | Panthrakikos | - | PAS Giannina | 1:2 | ||||
| 18. Round | 17/01/2010 | PAS Giannina | - | Aris Saloniki | 0:1 | ||||
| 19. Round | 24/01/2010 | AEK Athen | - | PAS Giannina | 3:1 | ||||
| 21. Round | 06/02/2010 | AO Kavala | - | PAS Giannina | 1:0 | ||||
| 22. Round | 13/02/2010 | PAS Giannina | - | PAOK Saloniki | 0:1 | ||||
| 23. Round | 21/02/2010 | PAS Giannina | - | Panionios GSS | 2:3 |
Greece