| 16. Round | 28/07/2024 | Rodina-M Moskva | - | FK Chertanovo | 3:3 | ||||
| 17. Round | 04/08/2024 | FK Chertanovo | - | Zvezda St. Petersburg | 1:0 | ||||
| 18. Round | 10/08/2024 | Zenit St. Petersburg 2 | - | FK Chertanovo | 2:0 | ||||
| 19. Round | 17/08/2024 | FK Chertanovo | - | Spartak Moskva 2 | 3:2 | ||||
| 20. Round | 25/08/2024 | FC Irkutsk | - | FK Chertanovo | 1:0 | ||||
| 21. Round | 01/09/2024 | FK Chertanovo | - | FK Saturn | 0:1 | ||||
| 23. Round | 15/09/2024 | FK Chertanovo | - | Dinamo Vologda | 0:1 | ||||
| 22. Round | 19/09/2024 | Dinamo Moskva 2 | - | FK Chertanovo | 2:1 | ||||
| 26. Round | 06/10/2024 | FK Chertanovo | - | Torpedo Vladimir | 2:0 | ||||
| 29. Round | 27/10/2024 | Baltika Kaliningrad 2 | - | FK Chertanovo | 1:3 |
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