| 5. Round | 15/03/2025 | Mushuc Runa | - | Vinotinto | 1:2 | ||||
| 6. Round | 30/03/2025 | Mushuc Runa | - | Emelec | 1:1 | ||||
| 8. Round | 14/04/2025 | Mushuc Runa | - | LDU Quito | 1:0 | ||||
| 9. Round | 19/04/2025 | Libertad de Loja | - | Mushuc Runa | 2:1 |  |
|||
| 11. Round | 04/05/2025 | Mushuc Runa | - | Macará | 4:3 | ||||
| 12. Round | 10/05/2025 | Manta | - | Mushuc Runa | 2:1 | ||||
| 13. Round | 17/05/2025 | Mushuc Runa | - | Orense SC | 2:5 | ||||
| 14. Round | 23/05/2025 | Independiente del Valle | - | Mushuc Runa | 2:1 | ||||
| 15. Round | 01/06/2025 | Mushuc Runa | - | El Nacional | 2:3 |  |
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| 17. Round | 23/06/2025 | Mushuc Runa | - | Barcelona | 0:5 | ||||
| 18. Round | 28/06/2025 | Deportivo Cuenca | - | Mushuc Runa | 1:0 | |
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| 19. Round | 05/07/2025 | Mushuc Runa | - | Universidad Catolica | 1:1 | |
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