| 6. Round | 07/10/2012 | PAS Giannina | - | Panionios GSS | 1:2 | ||||
| 7. Round | 21/10/2012 | Panthrakikos | - | PAS Giannina | 0:3 | ||||
| 9. Round | 04/11/2012 | Asteras Tripolis | - | PAS Giannina | 2:0 | ||||
| 10. Round | 10/11/2012 | PAS Giannina | - | Skoda Xanthi | 1:0 | ||||
| 11. Round | 17/11/2012 | Aris Saloniki | - | PAS Giannina | 1:2 | ||||
| 13. Round | 03/12/2012 | AEK Athen | - | PAS Giannina | 2:1 | ||||
| 17. Round | 13/01/2013 | PAS Giannina | - | Panathinaikos | 0:0 | ||||
| 18. Round | 20/01/2013 | Olympiakos Piraeus | - | PAS Giannina | 2:0 | ||||
| 22. Round | 16/02/2013 | PAS Giannina | - | Panthrakikos | 0:0 | ||||
| 23. Round | 24/02/2013 | Atromitos | - | PAS Giannina | 0:0 | ||||
| 24. Round | 03/03/2013 | PAS Giannina | - | Asteras Tripolis | 1:2 | ||||
| 27. Round | 30/03/2013 | OFI Heraklion | - | PAS Giannina | 2:1 |  |
|||
| 28. Round | 08/04/2013 | PAS Giannina | - | AEK Athen | 2:0 | ||||
| 29. Round | 14/04/2013 | PAS Giannina | - | AO Kerkyra | 1:0 |
Greece