| 1. Round | 11/01/2003 | Atlante | - | CF Monterrey | 1:1 | ||||
| 2. Round | 17/01/2003 | Deportivo Toluca | - | Atlante | 2:3 | ||||
| 3. Round | 25/01/2003 | Atlante | - | Atlas Guadalajara | 2:4 | ||||
| 4. Round | 01/02/2003 | Gallos Blancos (old) | - | Atlante | 1:0 |  |
|||
| 5. Round | 08/02/2003 | Atlante | - | Puebla FC | 3:1 | ||||
| 6. Round | 15/02/2003 | CF América | - | Atlante | 1:0 | ||||
| 7. Round | 22/02/2003 | Atlante | - | Jaguares Chiapas | 5:1 | ||||
| 8. Round | 28/02/2003 | Cruz Azul | - | Atlante | 1:3 | ||||
| 9. Round | 08/03/2003 | Atlante | - | UAG Tecos | 3:2 | ||||
| 10. Round | 14/03/2003 | UANL Tigres | - | Atlante | 2:1 | ||||
| 11. Round | 22/03/2003 | Atlante | - | CF Pachuca | 2:1 | |
|||
| 12. Round | 29/03/2003 | Deportivo Guadalajara | - | Atlante | 2:3 | ||||
| 13. Round | 05/04/2003 | Atlante | - | Real San Luis | 3:1 | |
|||
| 14. Round | 12/04/2003 | Santos Laguna | - | Atlante | 1:0 | ||||
| 15. Round | 19/04/2003 | Atlante | - | Club Necaxa | 4:1 |  |
|
||
| 16. Round | 25/04/2003 | Atlético Cuernavaca | - | Atlante | 1:1 | ||||
| 17. Round | 02/05/2003 | Monarcas Morelia | - | Atlante | 0:0 | ||||
| 18. Round | 10/05/2003 | Atlante | - | Pumas UNAM | 3:1 | ||||
| 19. Round | 16/05/2003 | Veracruz (old) | - | Atlante | 2:2 | |
|
Chile