| 1. Round | 09/07/2016 | Club Nacional | - | Deportivo Capiatá | 2:2 | ||||
| 3. Round | 19/07/2016 | General Díaz | - | Deportivo Capiatá | 0:1 |  |
|||
| 4. Round | 24/07/2016 | Deportivo Capiatá | - | Guaraní | 1:1 | ||||
| 5. Round | 30/07/2016 | Club Olimpia | - | Deportivo Capiatá | 4:0 | ||||
| 6. Round | 06/08/2016 | Deportivo Capiatá | - | Club Rubio Ñu | 1:0 |  |
|||
| 7. Round | 13/08/2016 | General Caballero ZC | - | Deportivo Capiatá | 1:2 | ||||
| 8. Round | 19/08/2016 | Deportivo Capiatá | - | River Plate | 0:3 | ||||
| 9. Round | 30/08/2016 | Sportivo Luqueño | - | Deportivo Capiatá | 0:4 | |
|||
| 10. Round | 10/09/2016 | Cerro Porteño | - | Deportivo Capiatá | 2:1 | ||||
| 12. Round | 25/09/2016 | Deportivo Capiatá | - | Club Nacional | 0:1 | ||||
| 13. Round | 01/10/2016 | Libertad | - | Deportivo Capiatá | 1:1 | ||||
| 11. Round | 08/10/2016 | Deportivo Capiatá | - | Sol de América | 1:1 | ||||
| 15. Round | 23/10/2016 | Guaraní | - | Deportivo Capiatá | 1:1 | ||||
| 16. Round | 29/10/2016 | Deportivo Capiatá | - | Club Olimpia | 1:0 | ||||
| 17. Round | 04/11/2016 | Club Rubio Ñu | - | Deportivo Capiatá | 0:1 | ||||
| 21. Round | 12/12/2016 | Deportivo Capiatá | - | Cerro Porteño | 2:2 | ||||
| 22. Round | 17/12/2016 | Sol de América | - | Deportivo Capiatá | 0:3 |
Paraguay