| 20. Round | 06/03/2009 | FC Gratkorn | - | SKNV St. Pölten | 2:1 | ||||
| 21. Round | 13/03/2009 | SV Grödig | - | SKNV St. Pölten | 3:0 | ||||
| 22. Round | 17/03/2009 | SKNV St. Pölten | - | Austria Lustenau | 1:0 | ||||
| 23. Round | 20/03/2009 | FC Wacker Innsbruck | - | SKNV St. Pölten | 3:0 | ||||
| 26. Round | 18/04/2009 | SKNV St. Pölten | - | RB Salzburg (A) | 3:1 | ||||
| 27. Round | 24/04/2009 | FC Lustenau | - | SKNV St. Pölten | 2:0 | ||||
| 28. Round | 01/05/2009 | SKNV St. Pölten | - | 1. FC RFE Vöcklabruck | 5:1 | ||||
| 31. Round | 15/05/2009 | DSV Leoben | - | SKNV St. Pölten | 2:1 | ||||
| 32. Round | 19/05/2009 | SC Magna Wiener Neustadt | - | SKNV St. Pölten | 4:1 | ||||
| 33. Round | 29/05/2009 | SKNV St. Pölten | - | Austria Lustenau | 1:1 |
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