| 1. Round | 22/01/2006 | Monarcas Morelia | - | Cruz Azul | 0:1 |  |
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| 2. Round | 28/01/2006 | Cruz Azul | - | Atlas Guadalajara | 1:1 | |
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| 3. Round | 02/02/2006 | UAG Tecos | - | Cruz Azul | 2:1 | |
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| 4. Round | 04/02/2006 | Cruz Azul | - | Deportivo Toluca | 2:1 | |
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| 5. Round | 11/02/2006 | Jaguares Chiapas | - | Cruz Azul | 1:0 | ||||
| 6. Round | 18/02/2006 | Cruz Azul | - | Pumas UNAM | 3:1 | ||||
| 7. Round | 25/02/2006 | Atlante | - | Cruz Azul | 1:2 | ||||
| 8. Round | 04/03/2006 | Cruz Azul | - | UANL Tigres | 1:1 | |
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| 9. Round | 11/03/2006 | Dorados de Sinaloa | - | Cruz Azul | 2:2 | |
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| 10. Round | 16/03/2006 | Cruz Azul | - | Santos Laguna | 4:1 | |
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| 11. Round | 19/03/2006 | Deportivo Guadalajara | - | Cruz Azul | 1:0 | ||||
| 12. Round | 25/03/2006 | Cruz Azul | - | Club Necaxa | 3:1 | ||||
| 13. Round | 02/04/2006 | Club San Luis | - | Cruz Azul | 2:1 |
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