| 2. Round | 28/07/2013 | Atlante | - | CD Veracruz | 2:4 | ||||
| 3. Round | 31/07/2013 | Atlante | - | Atlas Guadalajara | 1:1 | ||||
| 4. Round | 04/08/2013 | Deportivo Guadalajara | - | Atlante | 1:0 | ||||
| 5. Round | 11/08/2013 | Atlante | - | CF América | 2:4 | ||||
| 7. Round | 25/08/2013 | Atlante | - | CF Pachuca | 1:1 | ||||
| 8. Round | 01/09/2013 | Puebla FC | - | Atlante | 1:0 | ||||
| 9. Round | 08/09/2013 | Atlante | - | Monarcas Morelia | 2:2 | ||||
| 10. Round | 14/09/2013 | Gallos Blancos | - | Atlante | 1:0 | ||||
| 11. Round | 22/09/2013 | Atlante | - | Pumas UNAM | 1:0 | ||||
| 12. Round | 29/09/2013 | Deportivo Toluca | - | Atlante | 7:1 |  |
|||
| 14. Round | 20/10/2013 | UANL Tigres | - | Atlante | 3:1 | ||||
| 16. Round | 02/11/2013 | Club Tijuana | - | Atlante | 4:1 | ||||
| 17. Round | 10/11/2013 | Atlante | - | Chiapas FC | 2:0 |
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