| 1. Round | 01/08/2016 | Emelec | - | Delfín SC | 1:0 | ||||
| 2. Round | 06/08/2016 | Universidad Catolica | - | Emelec | 1:0 | ||||
| 4. Round | 20/08/2016 | LDU Quito | - | Emelec | 2:1 |  |
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| 5. Round | 27/08/2016 | Emelec | - | Deportivo Cuenca | 2:1 | |
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| 8. Round | 18/09/2016 | Mushuc Runa | - | Emelec | 3:0 | |
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| 9. Round | 21/09/2016 | Emelec | - | Club Deportivo River Plate Ecuador | 5:0 | |
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| 10. Round | 25/09/2016 | Emelec | - | Independiente del Valle | 2:1 |  |
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| 14. Round | 20/10/2016 | Club Deportivo River Plate Ecuador | - | Emelec | 0:2 | ||||
| 15. Round | 22/10/2016 | Emelec | - | Mushuc Runa | 3:2 | |
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| 3. Round | 26/10/2016 | Emelec | - | Barcelona | 0:1 | |
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| 16. Round | 30/10/2016 | El Nacional | - | Emelec | 1:2 | |
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| 17. Round | 04/11/2016 | Emelec | - | Aucas | 2:1 | ||||
| 19. Round | 19/11/2016 | Emelec | - | LDU Quito | 3:0 | |
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| 18. Round | 24/11/2016 | Deportivo Cuenca | - | Emelec | 2:2 | ||||
| 20. Round | 27/11/2016 | Barcelona | - | Emelec | 1:2 | |
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