| 1. Round | 07/09/1996 | Paniliakos Pyrgos | - | Skoda Xanthi | 3:1 |  |
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| 2. Round | 14/09/1996 | AO Edessaikos | - | Paniliakos Pyrgos | 0:1 | |
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| 3. Round | 28/09/1996 | Paniliakos Pyrgos | - | AO Kavala | 0:0 | ||||
| 5. Round | 19/10/1996 | Paniliakos Pyrgos | - | AGS Kastoria | 2:1 | ||||
| 10. Round | 30/11/1996 | Veria FC | - | Paniliakos Pyrgos | 2:0 | |
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| 11. Round | 08/12/1996 | Paniliakos Pyrgos | - | PS Kalamata | 4:0 | ||||
| 14. Round | 04/01/1997 | Olympiakos Piraeus | - | Paniliakos Pyrgos | 1:0 | ||||
| 15. Round | 11/01/1997 | Paniliakos Pyrgos | - | Athinaikos | 2:3 | ||||
| 16. Round | 15/01/1997 | AEK Athen | - | Paniliakos Pyrgos | 2:0 | ||||
| 17. Round | 19/01/1997 | Paniliakos Pyrgos | - | Panachaiki GE | 1:0 | ||||
| 18. Round | 25/01/1997 | Skoda Xanthi | - | Paniliakos Pyrgos | 1:0 | ||||
| 19. Round | 01/02/1997 | Paniliakos Pyrgos | - | AO Edessaikos | 4:0 | ||||
| 20. Round | 08/02/1997 | AO Kavala | - | Paniliakos Pyrgos | 1:0 | ||||
| 21. Round | 15/02/1997 | Paniliakos Pyrgos | - | Aris Saloniki | 1:1 | |
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| 24. Round | 08/03/1997 | OFI Heraklion | - | Paniliakos Pyrgos | 3:1 |
Greece