| 13. Round | 05/11/2016 | FK Bregalnica Štip | - | Vardar Skopje | 0:1 | ||||
| 16. Round | 27/11/2016 | Vardar Skopje | - | FK Renova | 1:0 |  |
|||
| 19. Round | 19/02/2017 | Vardar Skopje | - | KF Shkupi | 3:0 | ||||
| 20. Round | 26/02/2017 | Vardar Skopje | - | KF Shkëndija 79 | 3:1 | |
|||
| 23. Round | 18/03/2017 | Makedonija GP | - | Vardar Skopje | 0:5 |  |
|||
| 28. Round | 23/04/2017 | KF Shkupi | - | Vardar Skopje | 0:2 | ||||
| 29. Round | 26/04/2017 | KF Shkëndija 79 | - | Vardar Skopje | 3:1 | ||||
| 33. Round | 14/05/2017 | FK Rabotnički | - | Vardar Skopje | 2:2 | ||||
| 36. Round | 31/05/2017 | Vardar Skopje | - | Sileks Kratovo | 0:0 |
North Macedonia