| 24. Round | 28/01/2000 | CP Mérida | - | SD Compostela | 0:1 | ||||
| 25. Round | 05/02/2000 | SD Compostela | - | Atlético Madrid B | 1:1 | ||||
| 26. Round | 12/02/2000 | CD Leganés | - | SD Compostela | 3:1 | ||||
| 29. Round | 04/03/2000 | Córdoba CF | - | SD Compostela | 1:0 |  |
|||
| 33. Round | 01/04/2000 | UD Salamanca | - | SD Compostela | 0:0 | |
|||
| 34. Round | 08/04/2000 | SD Compostela | - | Albacete | 1:1 | |
|||
| 35. Round | 15/04/2000 | CD Badajoz | - | SD Compostela | 2:2 | ||||
| 36. Round | 22/04/2000 | SD Compostela | - | Getafe CF | 3:2 |  |
|
||
| 37. Round | 29/04/2000 | SD Eibar | - | SD Compostela | 0:0 | ||||
| 38. Round | 06/05/2000 | SD Compostela | - | Elche CF | 1:1 | ||||
| 39. Round | 12/05/2000 | Villarreal CF | - | SD Compostela | 1:1 | ||||
| 40. Round | 20/05/2000 | SD Compostela | - | Levante UD | 4:1 | ||||
| 41. Round | 27/05/2000 | CD Tenerife | - | SD Compostela | 0:0 | ||||
| 42. Round | 03/06/2000 | SD Compostela | - | Sporting Gijón | 1:1 |
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