| 1. Round | 09/07/2016 | Sol de América | - | Cerro Porteño | 3:2 | ||||
| 2. Round | 16/07/2016 | Cerro Porteño | - | Club Nacional | 1:1 |  |
|||
| 3. Round | 20/07/2016 | Libertad | - | Cerro Porteño | 1:1 | ||||
| 4. Round | 23/07/2016 | Cerro Porteño | - | General Díaz | 2:3 |  |
|||
| 5. Round | 31/07/2016 | Guaraní | - | Cerro Porteño | 0:2 | |
|||
| 7. Round | 13/08/2016 | Club Rubio Ñu | - | Cerro Porteño | 0:4 | ||||
| 8. Round | 21/08/2016 | Cerro Porteño | - | General Caballero ZC | 1:2 | ||||
| 9. Round | 29/08/2016 | River Plate | - | Cerro Porteño | 2:3 | ||||
| 10. Round | 10/09/2016 | Cerro Porteño | - | Deportivo Capiatá | 2:1 | |
|||
| 16. Round | 30/10/2016 | Cerro Porteño | - | Guaraní | 1:3 | ||||
| 17. Round | 06/11/2016 | Club Olimpia | - | Cerro Porteño | 4:2 | |
|||
| 18. Round | 19/11/2016 | Cerro Porteño | - | Club Rubio Ñu | 1:0 | ||||
| 19. Round | 27/11/2016 | General Caballero ZC | - | Cerro Porteño | 1:1 | ||||
| 20. Round | 02/12/2016 | Cerro Porteño | - | River Plate | 4:0 | |
|||
| 12. Round | 06/12/2016 | Cerro Porteño | - | Sol de América | 2:2 | |
|||
| 21. Round | 12/12/2016 | Deportivo Capiatá | - | Cerro Porteño | 2:2 | |
|||
| 22. Round | 17/12/2016 | Cerro Porteño | - | Sportivo Luqueño | 4:1 |
Paraguay