| 1. Round | 28/08/2006 | Vitória Setúbal | - | Académica de Coimbra | 1:1 |  |
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| 2. Round | 10/09/2006 | Académica de Coimbra | - | Naval 1° de Maio | 1:2 | ||||
| 3. Round | 17/09/2006 | Académica de Coimbra | - | Os Belenenses | 1:1 | |
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| 5. Round | 01/10/2006 | Académica de Coimbra | - | CD Nacional | 1:3 | ||||
| 8. Round | 28/10/2006 | União Leiria | - | Académica de Coimbra | 2:0 | |
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| 9. Round | 05/11/2006 | Académica de Coimbra | - | Estrela Amadora | 2:0 | |
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| 10. Round | 18/11/2006 | FC Porto | - | Académica de Coimbra | 2:1 |
Portugal