| 1. Round | 15/07/2012 | Emelec | - | Deportivo Cuenca | 1:0 | ||||
| 2. Round | 21/07/2012 | Deportivo Cuenca | - | Club Social y Deportivo Independiente José Terán | 2:1 | ||||
| 3. Round | 26/07/2012 | Macará | - | Deportivo Cuenca | 2:0 | ||||
| 5. Round | 05/08/2012 | Manta | - | Deportivo Cuenca | 2:0 | ||||
| 6. Round | 10/08/2012 | Deportivo Cuenca | - | Deportivo Quito | 0:0 | ||||
| 7. Round | 19/08/2012 | LDU Quito | - | Deportivo Cuenca | 0:2 | ||||
| 8. Round | 25/08/2012 | Deportivo Cuenca | - | Barcelona | 1:2 | ||||
| 10. Round | 15/09/2012 | El Nacional | - | Deportivo Cuenca | 1:1 | ||||
| 13. Round | 30/09/2012 | Deportivo Cuenca | - | El Nacional | 1:0 |  |
|||
| 14. Round | 04/10/2012 | Deportivo Cuenca | - | Técnico Universitario | 1:3 |  |
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