| 2. Round | 30/08/2009 | PAS Giannina | - | Panthrakikos | 2:0 | ||||
| 3. Round | 12/09/2009 | Aris Saloniki | - | PAS Giannina | 1:0 | ||||
| 4. Round | 20/09/2009 | PAS Giannina | - | AEK Athen | 1:1 | ||||
| 5. Round | 26/09/2009 | AE Lárissa | - | PAS Giannina | 0:0 | ||||
| 9. Round | 01/11/2009 | PAS Giannina | - | Levadiakos | 1:1 | ||||
| 10. Round | 08/11/2009 | Asteras Tripolis | - | PAS Giannina | 3:0 |  |
|||
| 14. Round | 12/12/2009 | PAS Giannina | - | Ergotelis | 1:0 | ||||
| 15. Round | 19/12/2009 | Panathinaikos | - | PAS Giannina | 4:0 | ||||
| 16. Round | 06/01/2010 | PAS Giannina | - | Skoda Xanthi | 0:0 | |
|||
| 18. Round | 17/01/2010 | PAS Giannina | - | Aris Saloniki | 0:1 | ||||
| 19. Round | 24/01/2010 | AEK Athen | - | PAS Giannina | 3:1 | ||||
| 20. Round | 30/01/2010 | PAS Giannina | - | AE Lárissa | 2:0 | ||||
| 21. Round | 06/02/2010 | AO Kavala | - | PAS Giannina | 1:0 | ||||
| 22. Round | 13/02/2010 | PAS Giannina | - | PAOK Saloniki | 0:1 | ||||
| 24. Round | 28/02/2010 | Levadiakos | - | PAS Giannina | 4:1 | ||||
| 25. Round | 07/03/2010 | PAS Giannina | - | Asteras Tripolis | 1:0 | ||||
| 30. Round | 18/04/2010 | PAS Giannina | - | Panathinaikos | 0:1 |
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