| 1. Round | 20/08/2016 | Elche CF | - | Rayo Vallecano | 2:1 |  |
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| 2. Round | 27/08/2016 | Girona FC | - | Elche CF | 3:1 | ||||
| 3. Round | 03/09/2016 | Elche CF | - | CD Tenerife | 3:1 | ||||
| 4. Round | 11/09/2016 | UCAM Murcia CF | - | Elche CF | 1:1 | ||||
| 5. Round | 17/09/2016 | Elche CF | - | CD Lugo | 0:3 |  |
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| 6. Round | 21/09/2016 | SD Huesca | - | Elche CF | 0:3 | ||||
| 7. Round | 24/09/2016 | Elche CF | - | Levante UD | 0:1 | ||||
| 8. Round | 01/10/2016 | AD Alcorcón | - | Elche CF | 1:0 | ||||
| 9. Round | 08/10/2016 | Elche CF | - | Gimnàstic de Tarragona | 4:4 | |
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| 12. Round | 30/10/2016 | Sevilla Atlético | - | Elche CF | 2:0 | ||||
| 13. Round | 06/11/2016 | CD Numancia | - | Elche CF | 2:2 | |
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| 14. Round | 12/11/2016 | Elche CF | - | Real Valladolid | 2:0 | |
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| 15. Round | 18/11/2016 | UD Almería | - | Elche CF | 2:1 | ||||
| 16. Round | 27/11/2016 | Elche CF | - | RCD Mallorca | 1:0 |
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