| 2. Round | 10/07/2016 | Envigado FC | - | Atlético Huila | 1:0 | ||||
| 3. Round | 13/07/2016 | Atlético Huila | - | Cortuluá | 2:1 | ||||
| 4. Round | 17/07/2016 | La Equidad | - | Atlético Huila | 1:0 | ||||
| 9. Round | 21/08/2016 | Deportivo Pasto | - | Atlético Huila | 2:0 | ||||
| 10. Round | 28/08/2016 | Deportes Tolima | - | Atlético Huila | 1:1 | ||||
| 1. Round | 08/09/2016 | Atlético Huila | - | Atlético Junior | 3:1 | ||||
| 11. Round | 11/09/2016 | Atlético Huila | - | Alianza Petrolera | 2:2 | ||||
| 12. Round | 14/09/2016 | Jaguares de Córdoba | - | Atlético Huila | 0:0 | ||||
| 13. Round | 18/09/2016 | Atlético Huila | - | Águilas Doradas | 1:2 | ||||
| 14. Round | 24/09/2016 | Atlético Huila | - | Deportes Tolima | 1:2 | ||||
| 15. Round | 30/09/2016 | Atlético Huila | - | Fortaleza FC | 2:1 | ||||
| 16. Round | 16/10/2016 | Atlético Nacional | - | Atlético Huila | 4:0 |
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