| 1. Round | 21/01/2006 | Deportivo Toluca | - | Club Necaxa | 3:1 | ||||
| 2. Round | 29/01/2006 | Club San Luis | - | Deportivo Toluca | 1:3 |  |
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| 3. Round | 01/02/2006 | Deportivo Toluca | - | Veracruz (old) | 2:1 | ||||
| 8. Round | 05/03/2006 | Atlas Guadalajara | - | Deportivo Toluca | 0:1 | |
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| 9. Round | 11/03/2006 | Deportivo Toluca | - | UAG Tecos | 3:1 | ||||
| 10. Round | 16/03/2006 | CF América | - | Deportivo Toluca | 1:0 | ||||
| 11. Round | 18/03/2006 | Jaguares Chiapas | - | Deportivo Toluca | 2:0 | ||||
| 12. Round | 26/03/2006 | Deportivo Toluca | - | Pumas UNAM | 2:1 | |
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| 13. Round | 02/04/2006 | Atlante | - | Deportivo Toluca | 0:0 | |
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| 14. Round | 08/04/2006 | Deportivo Toluca | - | UANL Tigres | 1:1 | ||||
| 15. Round | 16/04/2006 | Dorados de Sinaloa | - | Deportivo Toluca | 1:1 | ||||
| 16. Round | 23/04/2006 | Deportivo Toluca | - | Santos Laguna | 1:2 | ||||
| 17. Round | 30/04/2006 | Deportivo Guadalajara | - | Deportivo Toluca | 0:2 |
Mexico