| 1. Round | 18/01/2009 | Club Necaxa | - | Pumas UNAM | 1:2 | ||||
| 2. Round | 25/01/2009 | Pumas UNAM | - | Santos Laguna | 1:0 | ||||
| 3. Round | 01/02/2009 | Deportivo Toluca | - | Pumas UNAM | 1:0 | ||||
| 4. Round | 08/02/2009 | Pumas UNAM | - | Monarcas Morelia | 0:1 | ||||
| 5. Round | 15/02/2009 | CF Pachuca | - | Pumas UNAM | 3:2 | ||||
| 6. Round | 19/02/2009 | Pumas UNAM | - | Jaguares Chiapas | 1:1 | ||||
| 15. Round | 26/04/2009 | Pumas UNAM | - | Deportivo Guadalajara | 1:1 |  |
|||
| 16. Round | 02/05/2009 | UAG Tecos | - | Pumas UNAM | 2:0 | ||||
| 17. Round | 10/05/2009 | Pumas UNAM | - | CF Monterrey | 3:0 | |
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