| 2. Round | 24/01/2009 | Club San Luis | - | CF Pachuca | 1:2 | ||||
| 4. Round | 08/02/2009 | CF América | - | CF Pachuca | 1:3 | ||||
| 5. Round | 15/02/2009 | CF Pachuca | - | Pumas UNAM | 3:2 | ||||
| 6. Round | 19/02/2009 | Puebla FC | - | CF Pachuca | 2:2 | ||||
| 7. Round | 21/02/2009 | CF Pachuca | - | Indios Juárez | 3:0 | ||||
| 10. Round | 14/03/2009 | CF Monterrey | - | CF Pachuca | 2:0 | ||||
| 13. Round | 12/04/2009 | CF Pachuca | - | Deportivo Toluca | 3:1 | ||||
| 17. Round | 10/05/2009 | Atlas Guadalajara | - | CF Pachuca | 0:5 |
Mexico