| 1. Round | 17/07/2016 | Pumas UNAM | - | Deportivo Guadalajara | 1:0 |  |
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| 6. Round | 21/08/2016 | Pumas UNAM | - | CF Monterrey | 5:3 | ||||
| 8. Round | 11/09/2016 | Pumas UNAM | - | Gallos Blancos | 4:1 | ||||
| 9. Round | 19/09/2016 | Santos Laguna | - | Pumas UNAM | 3:1 | ||||
| 10. Round | 22/09/2016 | Pumas UNAM | - | Atlas Guadalajara | 2:0 | ||||
| 11. Round | 25/09/2016 | CF América | - | Pumas UNAM | 2:1 | ||||
| 12. Round | 02/10/2016 | Pumas UNAM | - | Chiapas FC | 1:0 | ||||
| 13. Round | 16/10/2016 | Deportivo Toluca | - | Pumas UNAM | 2:1 | ||||
| 14. Round | 23/10/2016 | Pumas UNAM | - | UANL Tigres | 1:3 | ||||
| 15. Round | 29/10/2016 | CD Veracruz | - | Pumas UNAM | 1:4 | ||||
| 16. Round | 06/11/2016 | Pumas UNAM | - | Monarcas Morelia | 1:1 | ||||
| 17. Round | 21/11/2016 | Puebla FC | - | Pumas UNAM | 0:3 |
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