| 2. Round | 06/11/2016 | OFI Heraklion | - | AEL Kalloni | 2:2 | ||||
| 4. Round | 05/12/2016 | Aris Saloniki | - | AEL Kalloni | 5:0 | ||||
| 9. Round | 08/01/2017 | AEL Kalloni | - | Kissamikos | 1:1 | ||||
| 11. Round | 18/01/2017 | Panelefsiniakos Elefsinas | - | AEL Kalloni | 3:1 | ||||
| 13. Round | 29/01/2017 | AO Chania | - | AEL Kalloni | 4:0 | ||||
| 14. Round | 05/02/2017 | AEL Kalloni | - | GS Kallithea | 2:0 | ||||
| 15. Round | 12/02/2017 | Panegialios FC | - | AEL Kalloni | 2:0 | ||||
| 17. Round | 22/02/2017 | Panserraikos | - | AEL Kalloni | 3:1 | ||||
| 19. Round | 05/03/2017 | AEL Kalloni | - | OFI Heraklion | 1:2 |
Greece