| 2. Round | 22/08/2020 | HNK Cibalia | - | NK Međimurje | 3:3 | ||||
| 4. Round | 12/09/2020 | HNK Orijent Rijeka | - | NK Međimurje | 0:1 | ||||
| 5. Round | 16/09/2020 | NK Međimurje | - | Hrvatski Dragovoljac | 1:1 | ||||
| 6. Round | 20/09/2020 | NK Osijek II | - | NK Međimurje | 6:0 | ||||
| 7. Round | 26/09/2020 | NK Međimurje | - | NK Junak Sinj | 4:3 | ||||
| 8. Round | 30/09/2020 | NK Dugopolje | - | NK Međimurje | 4:1 | ||||
| 9. Round | 03/10/2020 | NK Međimurje | - | NK Croatia Zmijavci | 2:1 | ||||
| 10. Round | 16/10/2020 | NK Međimurje | - | NK Inter Zaprešić | 3:2 | ||||
| 15. Round | 29/11/2020 | Hajduk Split II | - | NK Međimurje | 4:0 | ||||
| 13. Round | 02/12/2020 | Dinamo Zagreb II | - | NK Međimurje | 5:2 | ||||
| 17. Round | 12/12/2020 | NK Solin | - | NK Međimurje | 1:0 | ||||
| 20. Round | 26/02/2021 | NK Dubrava | - | NK Međimurje | 0:0 | ||||
| 24. Round | 03/04/2021 | NK Junak Sinj | - | NK Međimurje | 4:2 | ||||
| 26. Round | 17/04/2021 | NK Croatia Zmijavci | - | NK Međimurje | 4:2 | ||||
| 27. Round | 21/04/2021 | NK Inter Zaprešić | - | NK Međimurje | 1:0 | ||||
| 28. Round | 25/04/2021 | NK Međimurje | - | NK Kustošija | 0:4 | ||||
| 29. Round | 01/05/2021 | NK Opatija | - | NK Međimurje | 1:1 | ||||
| 30. Round | 08/05/2021 | NK Međimurje | - | Dinamo Zagreb II | 0:1 |  |
Croatia