| 1. Round | 11/08/2024 | KF Besa Dobërdoll | - | KF Shkëndija 79 | 1:3 | ||||
| 2. Round | 18/08/2024 | KF Shkëndija 79 | - | FK Rabotnički | 1:1 | ||||
| 3. Round | 25/08/2024 | FK AP Brera Strumica | - | KF Shkëndija 79 | 0:2 | ||||
| 4. Round | 31/08/2024 | KF Shkëndija 79 | - | FK Pelister | 2:0 | ||||
| 5. Round | 15/09/2024 | KF Shkupi | - | KF Shkëndija 79 | 1:1 | ||||
| 6. Round | 22/09/2024 | KF Shkëndija 79 | - | FK Voska Sport | 5:1 | ||||
| 8. Round | 29/09/2024 | KF Shkëndija 79 | - | Vardar Skopje | 4:0 | ||||
| 10. Round | 20/10/2024 | GFK Tikvesh | - | KF Shkëndija 79 | 0:0 | ||||
| 11. Round | 27/10/2024 | KF Shkëndija 79 | - | FC Struga | 1:1 | ||||
| 12. Round | 30/10/2024 | KF Shkëndija 79 | - | KF Besa Dobërdoll | 2:1 | ||||
| 14. Round | 09/11/2024 | KF Shkëndija 79 | - | FK AP Brera Strumica | 4:3 | ||||
| 16. Round | 27/11/2024 | KF Shkëndija 79 | - | KF Shkupi | 2:0 | ||||
| 20. Round | 23/02/2025 | KF Shkëndija 79 | - | Sileks Kratovo | 4:2 | ||||
| 22. Round | 05/03/2025 | FC Struga | - | KF Shkëndija 79 | 3:0 | ||||
| 23. Round | 09/03/2025 | KF Shkëndija 79 | - | FK Pelister | 1:0 | ||||
| 27. Round | 13/04/2025 | KF Shkëndija 79 | - | FK Voska Sport | 4:0 |  |
North Macedonia
Albania