| 21. Round | 19/02/2017 | RB Leipzig II | - | Wacker Nordhausen | 0:1 | ||||
| 23. Round | 04/03/2017 | FC Viktoria 1889 Berlin | - | Wacker Nordhausen | 2:1 | ||||
| 18. Round | 29/03/2017 | Wacker Nordhausen | - | SV Babelsberg 03 | 3:2 | ||||
| 26. Round | 01/04/2017 | Wacker Nordhausen | - | VfB Auerbach | 0:2 | ||||
| 27. Round | 09/04/2017 | FSV Budissa Bautzen | - | Wacker Nordhausen | 0:1 | ||||
| 28. Round | 13/04/2017 | Wacker Nordhausen | - | FC Carl Zeiss Jena | 2:4 | ||||
| 34. Round | 20/05/2017 | Wacker Nordhausen | - | FSV 63 Luckenwalde | 3:0 |  |
Germany