| 6. Round | 26/08/2012 | Deportivo Guadalajara | - | CF Monterrey | 1:2 | ||||
| 7. Round | 02/09/2012 | Deportivo Guadalajara | - | Puebla FC | 1:1 |  |
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| 8. Round | 15/09/2012 | Club León | - | Deportivo Guadalajara | 1:2 | ||||
| 9. Round | 23/09/2012 | Deportivo Guadalajara | - | Pumas UNAM | 0:0 | ||||
| 10. Round | 30/09/2012 | CF Pachuca | - | Deportivo Guadalajara | 1:0 | ||||
| 11. Round | 03/10/2012 | Deportivo Guadalajara | - | UANL Tigres | 2:1 | |
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| 12. Round | 06/10/2012 | CF América | - | Deportivo Guadalajara | 1:3 | ||||
| 13. Round | 14/10/2012 | Deportivo Guadalajara | - | Jaguares Chiapas | 1:1 | ||||
| 14. Round | 22/10/2012 | Atlante | - | Deportivo Guadalajara | 3:1 | ||||
| 16. Round | 03/11/2012 | Gallos Blancos (old) | - | Deportivo Guadalajara | 0:1 | ||||
| 17. Round | 11/11/2012 | Deportivo Guadalajara | - | Club Tijuana | 0:2 |
Mexico