| 1. Round | 31/08/2008 | Atlético Madrid | - | Málaga CF | 4:0 | ||||
| 4. Round | 25/09/2008 | Málaga CF | - | Valencia CF | 0:2 | ||||
| 18. Round | 11/01/2009 | Real Betis | - | Málaga CF | 1:2 | ||||
| 19. Round | 18/01/2009 | Málaga CF | - | Espanyol Barcelona | 4:0 | ||||
| 20. Round | 25/01/2009 | Málaga CF | - | Atlético Madrid | 1:1 | ||||
| 21. Round | 31/01/2009 | Athletic Club | - | Málaga CF | 3:2 | ||||
| 38. Round | 31/05/2009 | Espanyol Barcelona | - | Málaga CF | 3:0 |
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