| 1. Round | 05/09/1996 | AGS Kastoria | - | Olympiakos Piraeus | 0:5 | ||||
| 2. Round | 15/09/1996 | AEK Athen | - | AGS Kastoria | 1:0 |  |
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| 3. Round | 28/09/1996 | AGS Kastoria | - | Skoda Xanthi | 2:2 | ||||
| 4. Round | 12/10/1996 | AO Kavala | - | AGS Kastoria | 0:0 | |
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| 5. Round | 19/10/1996 | Paniliakos Pyrgos | - | AGS Kastoria | 2:1 | |
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| 10. Round | 30/11/1996 | AGS Kastoria | - | Athinaikos | 1:0 | ||||
| 11. Round | 07/12/1996 | Panachaiki GE | - | AGS Kastoria | 3:0 | ||||
| 14. Round | 04/01/1997 | AGS Kastoria | - | Ionikos Nikea | 1:2 | |
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| 17. Round | 18/01/1997 | AGS Kastoria | - | PAOK Saloniki | 1:2 | |
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| 18. Round | 25/01/1997 | Olympiakos Piraeus | - | AGS Kastoria | 3:0 | ||||
| 19. Round | 01/02/1997 | AGS Kastoria | - | AEK Athen | 0:2 | ||||
| 20. Round | 08/02/1997 | Skoda Xanthi | - | AGS Kastoria | 6:0 |  |
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| 22. Round | 22/02/1997 | AGS Kastoria | - | Paniliakos Pyrgos | 1:2 | |
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| 23. Round | 01/03/1997 | OFI Heraklion | - | AGS Kastoria | 1:0 | ||||
| 24. Round | 08/03/1997 | AGS Kastoria | - | Iraklis Saloniki | 0:3 |
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