| 1. Round | 06/08/2006 | Boca Juniors | - | Banfield | 3:0 |  |
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| 2. Round | 12/08/2006 | Rosario Central | - | Boca Juniors | 1:2 | ||||
| 3. Round | 19/08/2006 | Boca Juniors | - | Independiente | 1:0 | ||||
| 4. Round | 27/08/2006 | San Lorenzo | - | Boca Juniors | 1:7 | |
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| 5. Round | 03/09/2006 | Boca Juniors | - | Estudiantes | 2:0 | |
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| 7. Round | 17/09/2006 | Boca Juniors | - | Godoy Cruz | 0:0 | ||||
| 8. Round | 24/09/2006 | Nueva Chicago | - | Boca Juniors | 0:1 | ||||
| 9. Round | 01/10/2006 | Boca Juniors | - | Vélez Sarsfield | 3:2 | ||||
| 10. Round | 08/10/2006 | River Plate | - | Boca Juniors | 3:1 | ||||
| 6. Round | 08/11/2006 | Gimnasia de La Plata | - | Boca Juniors | 1:4 | |
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| 15. Round | 12/11/2006 | Boca Juniors | - | Quilmes | 3:1 | |
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| 16. Round | 19/11/2006 | Gimnasia de Jujuy | - | Boca Juniors | 1:2 | ||||
| 17. Round | 26/11/2006 | Boca Juniors | - | Colón de Santa Fe | 4:1 | ||||
| 18. Round | 03/12/2006 | Belgrano de Córdoba | - | Boca Juniors | 1:0 | ||||
| 19. Round | 10/12/2006 | Boca Juniors | - | Lanús | 1:2 | |
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