| 5. Round | 16/03/2025 | Delfín SC | - | Deportivo Cuenca | 0:0 | ||||
| 7. Round | 06/04/2025 | Independiente del Valle | - | Deportivo Cuenca | 4:0 | ||||
| 8. Round | 10/04/2025 | Macará | - | Deportivo Cuenca | 0:1 | ||||
| 9. Round | 19/04/2025 | Deportivo Cuenca | - | Emelec | 0:1 | ||||
| 11. Round | 03/05/2025 | Deportivo Cuenca | - | Manta | 2:0 | ||||
| 12. Round | 10/05/2025 | Orense SC | - | Deportivo Cuenca | 1:0 |  |
|||
| 13. Round | 17/05/2025 | Deportivo Cuenca | - | Técnico Universitario | 2:0 | ||||
| 14. Round | 24/05/2025 | Barcelona | - | Deportivo Cuenca | 0:0 | ||||
| 15. Round | 01/06/2025 | Deportivo Cuenca | - | Universidad Catolica | 3:1 | ||||
| 16. Round | 15/06/2025 | Deportivo Cuenca | - | El Nacional | 4:1 |
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