| 6. Round | 21/09/2016 | FC Zimbru | - | CS Petrocub | 0:0 | ||||
| 9. Round | 25/09/2016 | CS Petrocub | - | FC Academia UTM | 0:1 | ||||
| 10. Round | 30/09/2016 | Speranţa Nisporeni | - | CS Petrocub | 1:0 | ||||
| 11. Round | 16/10/2016 | CS Petrocub | - | FC Sheriff | 0:0 |  |
|||
| 15. Round | 19/11/2016 | CS Petrocub | - | CF Ungheni | 5:0 | ||||
| 16. Round | 25/11/2016 | FC Saxan | - | CS Petrocub | 2:0 | |
|||
| 17. Round | 30/11/2016 | CS Petrocub | - | FC Zimbru | 1:2 | ||||
| 18. Round | 04/12/2016 | Dacia Chişinău | - | CS Petrocub | 1:1 | ||||
| 19. Round | 09/12/2016 | CS Petrocub | - | FC Milsami | 0:2 | ||||
| 20. Round | 24/02/2017 | FC Academia UTM | - | CS Petrocub | 2:1 | ||||
| 21. Round | 28/02/2017 | CS Petrocub | - | Speranţa Nisporeni | 1:1 | ||||
| 22. Round | 04/03/2017 | FC Sheriff | - | CS Petrocub | 4:0 | ||||
| 24. Round | 16/03/2017 | Dinamo-Auto | - | CS Petrocub | 2:2 | ||||
| 23. Round | 20/03/2017 | CS Petrocub | - | Speranţa Nisporeni | 0:0 | |
|||
| 26. Round | 04/04/2017 | CF Ungheni | - | CS Petrocub | 0:4 | ||||
| 27. Round | 09/04/2017 | CS Petrocub | - | FC Milsami | 3:1 | ||||
| 30. Round | 30/04/2017 | Dacia Chişinău | - | CS Petrocub | 1:0 |
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