| 1. Round | 07/09/1996 | OFI Heraklion | - | PAOK Saloniki | 3:1 |  |
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| 3. Round | 29/09/1996 | OFI Heraklion | - | AEK Athen | 2:1 |  |
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| 4. Round | 11/10/1996 | Skoda Xanthi | - | OFI Heraklion | 3:0 | ||||
| 5. Round | 19/10/1996 | OFI Heraklion | - | AO Kavala | 1:0 | ||||
| 6. Round | 26/10/1996 | AGS Kastoria | - | OFI Heraklion | 0:1 | ||||
| 10. Round | 30/11/1996 | OFI Heraklion | - | Apollon Smyrnis | 3:0 | |
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| 11. Round | 08/12/1996 | Athinaikos | - | OFI Heraklion | 0:0 | ||||
| 14. Round | 05/01/1997 | OFI Heraklion | - | Aris Saloniki | 2:2 | ||||
| 15. Round | 11/01/1997 | Ionikos Nikea | - | OFI Heraklion | 3:2 | ||||
| 16. Round | 14/01/1997 | OFI Heraklion | - | Panathinaikos | 0:0 | ||||
| 17. Round | 18/01/1997 | OFI Heraklion | - | Veria FC | 2:0 | ||||
| 18. Round | 25/01/1997 | PAOK Saloniki | - | OFI Heraklion | 2:1 | ||||
| 19. Round | 01/02/1997 | OFI Heraklion | - | Olympiakos Piraeus | 0:1 | ||||
| 20. Round | 08/02/1997 | AEK Athen | - | OFI Heraklion | 0:1 | |
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| 21. Round | 15/02/1997 | OFI Heraklion | - | Skoda Xanthi | 3:0 | |
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| 22. Round | 22/02/1997 | AO Kavala | - | OFI Heraklion | 2:1 | |
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| 23. Round | 01/03/1997 | OFI Heraklion | - | AGS Kastoria | 1:0 | ||||
| 24. Round | 08/03/1997 | OFI Heraklion | - | Paniliakos Pyrgos | 3:1 | |
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