| 1. Round | 03/03/2024 | FK Chayka | - | FK Novosibirsk | 0:0 | ||||
| 2. Round | 10/03/2024 | Rodina Moskva 2 | - | FK Novosibirsk | 1:2 | ||||
| 3. Round | 18/03/2024 | FK Novosibirsk | - | FK Ufa | 0:0 |  |
|||
| 5. Round | 30/03/2024 | FK Novosibirsk | - | FK Murom | 2:0 | ||||
| 6. Round | 03/04/2024 | FK Novosibirsk | - | FK Chelyabinsk | 3:1 | ||||
| 7. Round | 07/04/2024 | FK Novosibirsk | - | Metallurg Lipetsk | 1:0 | ||||
| 8. Round | 14/04/2024 | FK Krasnodar 2 | - | FK Novosibirsk | 1:1 | ||||
| 9. Round | 20/04/2024 | FK Novosibirsk | - | Rotor Volgograd | 2:0 | ||||
| 10. Round | 24/04/2024 | FK Novosibirsk | - | Rodina Moskva 2 | 1:1 | ||||
| 11. Round | 28/04/2024 | FK Ufa | - | FK Novosibirsk | 2:1 | ||||
| 12. Round | 05/05/2024 | FK Novosibirsk | - | Veles Moskva | 0:0 | |
|||
| 13. Round | 11/05/2024 | FK Murom | - | FK Novosibirsk | 1:1 | ||||
| 14. Round | 15/05/2024 | FK Chelyabinsk | - | FK Novosibirsk | 1:1 | ||||
| 15. Round | 19/05/2024 | Metallurg Lipetsk | - | FK Novosibirsk | 0:0 | ||||
| 16. Round | 26/05/2024 | FK Novosibirsk | - | FK Krasnodar 2 | 2:0 | |
|||
| 4. Round | 30/05/2024 | Veles Moskva | - | FK Novosibirsk | 1:1 | ||||
| 17. Round | 03/06/2024 | Rotor Volgograd | - | FK Novosibirsk | 1:0 | ||||
| 18. Round | 08/06/2024 | FK Novosibirsk | - | FK Chayka | 0:3 |
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