| 1. Round | 17/07/2016 | Atlas Guadalajara | - | Deportivo Toluca | 1:1 |  |
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| 2. Round | 24/07/2016 | CF América | - | Deportivo Toluca | 3:1 | |
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| 3. Round | 31/07/2016 | Chiapas FC | - | Deportivo Toluca | 1:0 | |
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| 4. Round | 07/08/2016 | Deportivo Toluca | - | CF Pachuca | 2:0 | ||||
| 5. Round | 14/08/2016 | Deportivo Toluca | - | UANL Tigres | 0:0 | ||||
| 7. Round | 28/08/2016 | Deportivo Toluca | - | Monarcas Morelia | 2:2 | ||||
| 8. Round | 12/09/2016 | Puebla FC | - | Deportivo Toluca | 0:2 | ||||
| 9. Round | 17/09/2016 | Deportivo Toluca | - | Deportivo Guadalajara | 2:1 | ||||
| 10. Round | 21/09/2016 | Cruz Azul | - | Deportivo Toluca | 0:1 | ||||
| 11. Round | 25/09/2016 | Deportivo Toluca | - | Club León | 1:1 | ||||
| 12. Round | 02/10/2016 | Club Necaxa | - | Deportivo Toluca | 3:1 | ||||
| 13. Round | 16/10/2016 | Deportivo Toluca | - | Pumas UNAM | 2:1 | ||||
| 14. Round | 23/10/2016 | CF Monterrey | - | Deportivo Toluca | 1:1 | ||||
| 15. Round | 30/10/2016 | Deportivo Toluca | - | Club Tijuana | 0:1 | ||||
| 16. Round | 05/11/2016 | Gallos Blancos | - | Deportivo Toluca | 2:3 | |
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| 17. Round | 20/11/2016 | Deportivo Toluca | - | Santos Laguna | 1:2 | |
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