| 3. Round | 20/07/2016 | Libertad | - | Cerro Porteño | 1:1 |  |
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| 4. Round | 23/07/2016 | Cerro Porteño | - | General Díaz | 2:3 | ||||
| 5. Round | 31/07/2016 | Guaraní | - | Cerro Porteño | 0:2 | ||||
| 6. Round | 06/08/2016 | Cerro Porteño | - | Club Olimpia | 1:1 |  |
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| 14. Round | 15/10/2016 | Cerro Porteño | - | Libertad | 2:1 | |
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| 17. Round | 06/11/2016 | Club Olimpia | - | Cerro Porteño | 4:2 | ||||
| 11. Round | 13/11/2016 | Sportivo Luqueño | - | Cerro Porteño | 0:0 | ||||
| 19. Round | 27/11/2016 | General Caballero ZC | - | Cerro Porteño | 1:1 | ||||
| 21. Round | 12/12/2016 | Deportivo Capiatá | - | Cerro Porteño | 2:2 | ||||
| 22. Round | 17/12/2016 | Cerro Porteño | - | Sportivo Luqueño | 4:1 |
Paraguay