| 1. Round | 09/08/2008 | Wisła Kraków | - | Polonia Bytom | 1:0 | ||||
| 3. Round | 22/08/2008 | Wisła Kraków | - | GKS Bełchatów | 2:1 | ||||
| 4. Round | 31/08/2008 | KS Cracovia | - | Wisła Kraków | 1:1 |  |
|||
| 5. Round | 14/09/2008 | Wisła Kraków | - | Lech Poznań | 1:4 | ||||
| 8. Round | 05/10/2008 | Górnik Zabrze | - | Wisła Kraków | 1:1 | ||||
| 11. Round | 02/11/2008 | Wisła Kraków | - | Ruch Chorzów | 2:0 | |
|||
| 12. Round | 08/11/2008 | Wisła Kraków | - | ŁKS Łódź | 0:0 | ||||
| 13. Round | 12/11/2008 | Odra Wodzisław | - | Wisła Kraków | 0:2 | ||||
| 15. Round | 23/11/2008 | Śląsk Wrocław | - | Wisła Kraków | 2:1 | ||||
| 16. Round | 29/11/2008 | Ruch Chorzów | - | Wisła Kraków | 1:0 | ||||
| 17. Round | 05/12/2008 | Wisła Kraków | - | Odra Wodzisław | 3:1 | ||||
| 18. Round | 27/02/2009 | Polonia Bytom | - | Wisła Kraków | 1:1 | ||||
| 22. Round | 05/04/2009 | Lech Poznań | - | Wisła Kraków | 1:1 |  |
|||
| 23. Round | 11/04/2009 | Wisła Kraków | - | Jagiellonia Białystok | 1:0 | ||||
| 27. Round | 10/05/2009 | Wisła Kraków | - | Legia Warszawa | 1:0 | ||||
| 28. Round | 17/05/2009 | ŁKS Łódź | - | Wisła Kraków | 0:4 | ||||
| 29. Round | 23/05/2009 | Lechia Gdańsk | - | Wisła Kraków | 2:4 | ||||
| 30. Round | 30/05/2009 | Wisła Kraków | - | Śląsk Wrocław | 2:0 |
Slovakia