| 2. Round | 25/08/2012 | Real Madrid Castilla | - | FC Barcelona B | 3:2 | ||||
| 9. Round | 15/10/2012 | Real Madrid Castilla | - | UD Las Palmas | 3:2 | ||||
| 10. Round | 20/10/2012 | Córdoba CF | - | Real Madrid Castilla | 1:0 |  |
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| 18. Round | 14/12/2012 | CD Lugo | - | Real Madrid Castilla | 3:2 | ||||
| 20. Round | 05/01/2013 | AD Alcorcón | - | Real Madrid Castilla | 3:2 | |
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| 22. Round | 19/01/2013 | Real Madrid Castilla | - | Villarreal CF | 5:0 | ||||
| 39. Round | 18/05/2013 | Real Madrid Castilla | - | CD Lugo | 3:1 | ||||
| 41. Round | 02/06/2013 | Real Madrid Castilla | - | AD Alcorcón | 4:0 | ||||
| 42. Round | 08/06/2013 | Girona FC | - | Real Madrid Castilla | 1:1 |
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