| 2. Round | 18/01/2025 | Atlante | - | Atlético La Paz | 5:0 | ||||
| 3. Round | 25/01/2025 | Atlético Morelia | - | Atlante | 0:2 | ||||
| 4. Round | 03/02/2025 | Venados FC | - | Atlante | 1:1 | ||||
| 5. Round | 08/02/2025 | Atlante | - | Tepatitlán | 1:0 |  |
|||
| 6. Round | 14/02/2025 | Alebrijes de Oaxaca | - | Atlante | 2:0 | ||||
| 7. Round | 22/02/2025 | Atlante | - | Coyotes de Tlaxcala | 2:1 |  |
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| 8. Round | 02/03/2025 | Dorados de Sinaloa | - | Atlante | 1:4 | |
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| 9. Round | 08/03/2025 | Atlante | - | Leones Negros | 2:1 | ||||
| 11. Round | 20/03/2025 | Tapatío | - | Atlante | 1:1 | |
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| 12. Round | 29/03/2025 | Atlante | - | Cancún FC | 4:1 | ||||
| 13. Round | 04/04/2025 | Correcaminos UAT | - | Atlante | 2:0 | ||||
| 14. Round | 13/04/2025 | Atlante | - | Mineros de Zacatecas | 0:0 | ||||
| 15. Round | 20/04/2025 | Jaiba Brava | - | Atlante | 1:1 |
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