| 1. Round | 13/08/2016 | The Strongest | - | CD Guabirá | 2:1 |  |
 |
||
| 4. Round | 11/09/2016 | CD Guabirá | - | Club San José | 5:2 | ||||
| 5. Round | 15/09/2016 | Petrolero de Yacuiba | - | CD Guabirá | 1:0 | ||||
| 6. Round | 18/09/2016 | Bolívar | - | CD Guabirá | 6:0 | ||||
| 7. Round | 25/09/2016 | CD Guabirá | - | Real Potosí | 3:0 | ||||
| 8. Round | 29/09/2016 | Jorge Wilstermann | - | CD Guabirá | 1:1 | ||||
| 9. Round | 16/10/2016 | CD Guabirá | - | Blooming | 0:4 | ||||
| 10. Round | 21/10/2016 | Sport Boys Warnes | - | CD Guabirá | 1:0 | ||||
| 13. Round | 01/11/2016 | Nacional Potosí | - | CD Guabirá | 2:1 | ||||
| 14. Round | 03/11/2016 | Real Potosí | - | CD Guabirá | 3:1 | ||||
| 16. Round | 23/11/2016 | CD Guabirá | - | Petrolero de Yacuiba | 1:0 | ||||
| 17. Round | 27/11/2016 | CD Guabirá | - | Bolívar | 1:2 | ||||
| 12. Round | 01/12/2016 | CD Guabirá | - | The Strongest | 0:3 | ||||
| 18. Round | 04/12/2016 | CD Guabirá | - | Oriente Petrolero | 1:2 | ||||
| 19. Round | 08/12/2016 | CD Guabirá | - | Jorge Wilstermann | 2:2 | ||||
| 20. Round | 11/12/2016 | Blooming | - | CD Guabirá | 3:1 | ||||
| 21. Round | 18/12/2016 | CD Guabirá | - | Sport Boys Warnes | 1:2 |
Paraguay