| 3. Round | 12/02/2017 | América de Cali | - | Atlético Junior | 3:1 | ||||
| 7. Round | 02/03/2017 | Envigado FC | - | Atlético Junior | 0:0 | ||||
| 8. Round | 06/03/2017 | Atlético Junior | - | Atlético Huila | 3:3 |  |
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| 9. Round | 12/03/2017 | Once Caldas | - | Atlético Junior | 3:3 | ||||
| 10. Round | 18/03/2017 | Atlético Junior | - | Once Caldas | 3:0 | |
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| 2. Round | 26/03/2017 | Atlético Junior | - | Jaguares de Córdoba | 1:2 | |
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| 6. Round | 30/03/2017 | Atlético Junior | - | Millonarios | 1:1 | |
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| 11. Round | 02/04/2017 | Atlético Junior | - | Cortuluá | 2:1 | ||||
| 13. Round | 19/04/2017 | Atlético Junior | - | Patriotas FC | 0:0 | ||||
| 14. Round | 23/04/2017 | Deportivo Cali | - | Atlético Junior | 3:1 | |
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| 5. Round | 27/04/2017 | Atlético Nacional | - | Atlético Junior | 2:1 | ||||
| 15. Round | 01/05/2017 | Atlético Junior | - | Independiente Medellín | 2:0 | |
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| 17. Round | 11/05/2017 | Atlético Junior | - | Atlético Bucaramanga | 3:1 | |
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| 18. Round | 14/05/2017 | Águilas Doradas | - | Atlético Junior | 1:0 | ||||
| 19. Round | 22/05/2017 | Atlético Junior | - | Deportes Tolima | 1:0 | ||||
| 20. Round | 28/05/2017 | Deportivo Pasto | - | Atlético Junior | 1:2 |
Paraguay
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